水质自动监测系统主要以在线自动分析仪器为核心。 采用自动控制技术、现代传感器技术、计算机应用技术、自动测量技术、相关专用分析软件和通信网络。 组成综合在线自动监测系统。实时、快速监测断面的水质变化情况、规律及变化趋势，及时发现水环境污染事件。为水污染防治决策、监督、水环境管理提供科学依据。
水质自动监控系统是多项技术的综合，其中包括化学分析技术、电气自动化技术、计算机技术、通讯技术以及电流技术等。某一技术环节出现问题都可能影响监测结果。参照监测面的现实状况，系统将针对性地选择分析性设备。水质监测的主要对象为：水质基本5参数，氨氮，高锰酸盐指数等。
为水资源可持续利用的实现，加强水资源管理，我国制定了大量法律法规。并进行了水功能区制度的确定。浅谈在水质自动监测运行管理过程中应采取的质量控制的措施：
1）监测人员培训后持证上岗
随着工作的逐步开展，我们发现水质监测工作是一项科学性与专业性较强的工作。监测人员只有牢记理论知识及检验检测方法、程序、制度和操作技能，才能够准确并详细记录和分析水质监测数据。所以，水站配备了专职且具有较强的责任心和较高的业务能力的运行维护人员。通过培训、考核后,持证上岗，保证了水站的良好运行。
2）试剂配制及有效性管理
水站所有使用的试剂级别均为分析纯或优级纯,且未失效;标准溶液贮存期按相关规定管理。严格管控保存时间;定期对各种化学试剂或标准溶液进行检查。一旦发现有变质,要及时更换,每次更换试剂后需对仪器进行校准。
3）日常质量控制
水站有定期校准仪器、定期核查仪器，且把这些方法作为水质自动监测日常运行质量保证及质量控制的主要措施。
定期校准：按照所监测黑龙江中游断面水质的实际情况。对水质自动监测分析仪器定期校准，校准时间根据实际情况确定。
定期核查仪器：采用国家规定标准物质或按规定方法配制的标准溶液对仪器进行核查测试。仪器设备经校准后，测定标准溶液，根据所测得结果计算仪器的准确度。标准溶液浓度值需控制在仪器量程中间值左右。
4）系统运行维护
水站定期对水质自动监测系统各仪器进行维护、维修、保养以保证系统的正常运行。
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