由于我们对环保领域的高度重视，水质监测工作也取得了不错的成绩，但这不代表就没有问题出现。目前，水质监测站网还没有覆盖所有地区，供水的企业需要按标准安装相应的水质检测项目，由于多方面的因素，并不是所有的企业都完成了水质检测指标，那么为了有效的应对水质监测中存在的问题，有以下几个方面需要重视。
我国的环境监测工作，同一个生态系统流域是有多个部门管辖，这么一来就缺少对全流域范围内的整体考虑。一旦出现突发水质污染事件，这样就会涉及到水利、环保、交通、供水、城市建设和规划等多个部门，如果不是同层级的就很难做到一致。由此可见，建立长期有效的水资源监测管理体系尤为重要，明确监测机构和人员的职能，各大部门的任务分工明确，同时需要相互协助配合，确保检测数据的科学性与公信力，为开展水资源监督、评价、考核等提供好的条件。
目前国内水质检测问题主要是以水质监测和水污染控制为主，对水质预测的分析研究还没有系统化。且自我国开展水质监测工作以来，累积了不少监测数据，监测成果并没有都被系统化利用。所以针对我们水质的监测现状及各种实验结果来分析，我们可以主要开展水质预测分析，包括不同河域、不同季节影响水质的各种因素，有准备的进行水质在线监测和水利应用，从而来提高水资源的服务能力。
我们知道水质监测行业是属于技术密集型的行业，涉及到的技术领域有多个，比如：电子、软件、机械等。这样是需要有经验累积才行的！还要以研发与技术人员推动行业的发展。这其实是目前该行业较为缺乏的，所以说增强投入力度，提升工作人员的综合素质尤为重要
就目前我国只有个别城市尝试数据监测方面引入第三方机构，很多地方还是会在当地环保部门内部安排相关部门进行监测工作，监测的质量各方面稳定性很难被公正监督，监测的过程如果存在问题也很麻烦。那么有了第三方机构监测的话，可以保证检测结果的真实可靠性！
水质监测的信息公开，无可厚非这是公众的知情权、参与权和监督权。需要定期公布数据和分析结果，实现公众与相关部门的信息互动。这样有助于恢复民众对水质的信心，从而提高大家对相关部门的信任，也有助于强化公众参与和社会监督！
